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基因體分析服務
次世代定序(Next Generation Sequencing)
次世代定序 (Next Generation Sequencing，簡稱 NGS) 技術的問世，大幅擴展基因體學研究的廣度與深度，已成為基因體學相關研究的利器。明欣生物科技為因應研究人員的需求，自 2007 年起即投入大量資本、技術人員與資訊設備，陸續引進多種 NGS 技術平台，並即時進行系統升級與更新，為國內外研究機構提供最先進的次世代定序服務。
明欣生物科技的次世代定序服務具有以下特色：- 多種技術平台：可依據您獨特的研究需求，選擇一種最合適的技術平台或多種技術平台的組合，不論是較單純的微生物基因體或極為複雜的人類基因體，從小規模的實驗室初探性研究到大規模多樣本的臨床與流行病學研究，都可以獲得解決方案。
- 在地技術支援：明欣生物科技位於南港生技園區的實驗室，配置有經驗豐富的專業團隊，協助您評估研究需求、設計實驗步驟、與解說分析結果，提供即時的在地技術支援。
- 完整服務方案：從實驗設計、樣品製備、實驗操作、到資料分析，以連貫性的服務，全程協助您完成複雜的研究專案與冗長的研究流程。
- 技術平台
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明欣生物科技建置的 NGS 技術平台包括 Applied Biosystems SOLiD™ 5500xl System、Roche 454 GS FLX Titanium System & GS Junior System、以及 Ion Torrent PGM™ system 等。各技術平台目前可達到之輸出通量與可讀序列長度摘要如下。
NGS System SOLiD™ 5500xl Ion Torrent PGM™ GS FLX Titanium GS Junior Throughput per run up to 180 Gb Chip 314: 10 MbChip 316: 100 MbChip 318: 1Gb 400 Mb 35 Mb Reads per run up to 2.8 B Chip 314: 0.1 MChip 316: 1 MChip 318: 10 M shotgun: 1 M amplicon: 0.7 M shotgun: 0.1 M amplicon: 70,000 Read Length Fragment 75 bp 100-200 bp 250-400 bp 250-400 bp Mate-pair 2 x 60 bp N/A 2 x 150 bp 2 x 150 bp Paired-end 75 x 35 bp 100 x 100 bp N/A N/A
- 服務項目與應用
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NGS 技術在研究上的應用相當廣泛，且仍在快速發展中。明欣生物科技不斷收集最新的研究報告，引進已臻成熟的應用，目前已經建立的NGS服務項目涵蓋 Genomics、Transcriptomics、Epigenomics 與 Cancer Genomics 等研究領域。
應用領域 服務項目 Genomics - Whole genome de novo sequencing
- Whole genome resequencing
- Targeted/Amplicon resequencing
- Exome sequencing
- Metagenomics sequencing
Transcriptomics - Transcriptome sequencing
- Small RNA sequencing
Epigenomics - Chromatin immunoprecipitation sequencing
- DNA methylation sequencing
Cancer Genomics
- 服務流程
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次世代定序的服務內容隨著多樣化的研究需求而異，考量服務成本較高且實驗方法繁複耗時，本公司採取以下的服務流程，以確保實驗結果符合客戶需求。
- 確認研究需求：請與本公司基因體實驗室聯繫 (電話：02-26557128，Email：genomics@missionbio.com.tw)，提供您的研究需求，所需資訊如「次世代定序服務諮詢與報價申請表」。經雙方溝通討論，確認研究需求。
- 確認委託服務方案：本公司依據確認的研究需求，提出委託服務方案，包含服務內容、分析方法、服務費用等，經客戶認可後確認之。
- 樣品收集及品質檢測：客戶依據「次世代定序樣品製備與遞送注意事項」，收集研究所需之樣品，連同填妥之「次世代定序服務委託單」，通知本公司派員收件或快遞送達本公司實驗室 (電話：02-26557128；郵遞區號 11503，地址：台北市南港區園區街 3 號 10 樓之 1)；本公司於收到樣品後先進行品質測定，測定結果若不符品質與量的要求，將通知客戶，討論解決方案。
- 執行實驗與資料分析：樣品質量均符合要求者，依據約定的服務內容執行各項實驗與資料分析；執行過程定期向客戶報告執行狀況。
- 交付資料及報告：提供客戶的資料及報告，包括實驗方法與步驟、原始數據、資料分析方法、資料分析結果圖表等。